Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMP4BP1P59074 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP4BP1P59074 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMP4BP1P59074 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMP4BP1P59074 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP4BP1P59074 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1143.7 ms