Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB25P57735 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB25P57735 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB25P57735 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB25P57735 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB25P57735 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB25P57735 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB25P57735 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB25P57735 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB25P57735 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB25P57735 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB25P57735 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB25P57735 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB25P57735 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB25P57735 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB25P57735 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB25P57735 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB25P57735 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB25P57735 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB25P57735 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB25P57735 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB25P57735 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB25P57735 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB25P57735 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB25P57735 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB25P57735 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB25P57735 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB25P57735 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB25P57735 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB25P57735 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB25P57735 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB25P57735 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB25P57735 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB25P57735 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB25P57735 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB25P57735 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB25P57735 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB25P57735 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB25P57735 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB25P57735 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB25P57735 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB25P57735 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB25P57735 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB25P57735 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB25P57735 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB25P57735 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB25P57735 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB25P57735 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB25P57735 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB25P57735 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB25P57735 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB25P57735 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB25P57735 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB25P57735 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB25P57735 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB25P57735 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB25P57735 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB25P57735 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB25P57735 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB25P57735 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB25P57735 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB25P57735 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB25P57735 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB25P57735 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB25P57735 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB25P57735 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB25P57735 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB25P57735 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB25P57735 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB25P57735 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB25P57735 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB25P57735 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB25P57735 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB25P57735 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB25P57735 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB25P57735 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB25P57735 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB25P57735 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB25P57735 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB25P57735 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB25P57735 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB25P57735 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB25P57735 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB25P57735 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB25P57735 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB25P57735 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB25P57735 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB25P57735 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB25P57735 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB25P57735 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB25P57735 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB25P57735 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB25P57735 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB25P57735 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB25P57735 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB25P57735 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB25P57735 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB25P57735 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB25P57735 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB25P57735 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms