Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCBP4P57723 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCBP4P57723 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCBP4P57723 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCBP4P57723 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCBP4P57723 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms