Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1H2P55055 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1H2P55055 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1H2P55055 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1H2P55055 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1H2P55055 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1H2P55055 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1H2P55055 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1H2P55055 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NR1H2P55055 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NR1H2P55055 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1H2P55055 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms