Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLCSP50747 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLCSP50747 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HLCSP50747 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLCSP50747 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HLCSP50747 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HLCSP50747 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLCSP50747 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLCSP50747 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLCSP50747 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLCSP50747 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLCSP50747 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLCSP50747 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLCSP50747 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLCSP50747 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLCSP50747 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLCSP50747 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLCSP50747 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLCSP50747 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLCSP50747 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLCSP50747 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLCSP50747 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLCSP50747 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLCSP50747 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLCSP50747 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLCSP50747 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLCSP50747 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLCSP50747 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLCSP50747 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLCSP50747 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLCSP50747 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLCSP50747 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HLCSP50747 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HLCSP50747 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HLCSP50747 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLCSP50747 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLCSP50747 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLCSP50747 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLCSP50747 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLCSP50747 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLCSP50747 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLCSP50747 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLCSP50747 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLCSP50747 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLCSP50747 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLCSP50747 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLCSP50747 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLCSP50747 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLCSP50747 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLCSP50747 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLCSP50747 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLCSP50747 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLCSP50747 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLCSP50747 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLCSP50747 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLCSP50747 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLCSP50747 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLCSP50747 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLCSP50747 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLCSP50747 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HLCSP50747 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HLCSP50747 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLCSP50747 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLCSP50747 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLCSP50747 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLCSP50747 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLCSP50747 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLCSP50747 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLCSP50747 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLCSP50747 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLCSP50747 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLCSP50747 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLCSP50747 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLCSP50747 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLCSP50747 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HLCSP50747 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HLCSP50747 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLCSP50747 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLCSP50747 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLCSP50747 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLCSP50747 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLCSP50747 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HLCSP50747 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLCSP50747 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HLCSP50747 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLCSP50747 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLCSP50747 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLCSP50747 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLCSP50747 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLCSP50747 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLCSP50747 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLCSP50747 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLCSP50747 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HLCSP50747 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HLCSP50747 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HLCSP50747 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HLCSP50747 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HLCSP50747 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HLCSP50747 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HLCSP50747 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms