Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANBP1P43487 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP1P43487 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RANBP1P43487 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms