Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBX1P40424 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBX1P40424 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBX1P40424 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBX1P40424 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBX1P40424 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBX1P40424 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBX1P40424 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBX1P40424 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PBX1P40424 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PBX1P40424 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PBX1P40424 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PBX1P40424 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PBX1P40424 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PBX1P40424 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PBX1P40424 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PBX1P40424 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PBX1P40424 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PBX1P40424 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PBX1P40424 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PBX1P40424 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PBX1P40424 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PBX1P40424 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PBX1P40424 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PBX1P40424 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PBX1P40424 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PBX1P40424 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PBX1P40424 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PBX1P40424 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PBX1P40424 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PBX1P40424 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PBX1P40424 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBX1P40424 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBX1P40424 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBX1P40424 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBX1P40424 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBX1P40424 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBX1P40424 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBX1P40424 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBX1P40424 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBX1P40424 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBX1P40424 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBX1P40424 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBX1P40424 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBX1P40424 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBX1P40424 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBX1P40424 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBX1P40424 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBX1P40424 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBX1P40424 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBX1P40424 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PBX1P40424 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBX1P40424 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBX1P40424 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBX1P40424 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBX1P40424 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBX1P40424 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PBX1P40424 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PBX1P40424 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PBX1P40424 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PBX1P40424 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PBX1P40424 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PBX1P40424 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PBX1P40424 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBX1P40424 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBX1P40424 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBX1P40424 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PBX1P40424 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PBX1P40424 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBX1P40424 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PBX1P40424 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PBX1P40424 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PBX1P40424 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PBX1P40424 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PBX1P40424 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PBX1P40424 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PBX1P40424 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PBX1P40424 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PBX1P40424 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PBX1P40424 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PBX1P40424 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PBX1P40424 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PBX1P40424 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PBX1P40424 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PBX1P40424 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PBX1P40424 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PBX1P40424 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PBX1P40424 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PBX1P40424 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PBX1P40424 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PBX1P40424 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PBX1P40424 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PBX1P40424 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PBX1P40424 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PBX1P40424 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PBX1P40424 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBX1P40424 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBX1P40424 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PBX1P40424 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBX1P40424 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms