Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SERPINB3P29508 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINB3P29508 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SERPINB3P29508 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SERPINB3P29508 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERPINB3P29508 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms