Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E2P29084 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E2P29084 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E2P29084 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms