Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GIFP27352 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIFP27352 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIFP27352 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIFP27352 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIFP27352 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIFP27352 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIFP27352 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIFP27352 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIFP27352 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIFP27352 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIFP27352 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIFP27352 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIFP27352 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GIFP27352 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIFP27352 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIFP27352 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIFP27352 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIFP27352 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIFP27352 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIFP27352 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIFP27352 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIFP27352 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIFP27352 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIFP27352 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIFP27352 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIFP27352 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIFP27352 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIFP27352 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIFP27352 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIFP27352 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIFP27352 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIFP27352 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIFP27352 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIFP27352 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIFP27352 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIFP27352 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIFP27352 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIFP27352 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIFP27352 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIFP27352 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIFP27352 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIFP27352 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIFP27352 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIFP27352 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIFP27352 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIFP27352 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIFP27352 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIFP27352 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIFP27352 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIFP27352 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIFP27352 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIFP27352 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIFP27352 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIFP27352 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIFP27352 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIFP27352 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIFP27352 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIFP27352 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIFP27352 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIFP27352 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIFP27352 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIFP27352 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIFP27352 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIFP27352 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIFP27352 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIFP27352 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIFP27352 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIFP27352 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIFP27352 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIFP27352 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIFP27352 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIFP27352 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIFP27352 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIFP27352 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIFP27352 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIFP27352 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GIFP27352 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIFP27352 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIFP27352 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GIFP27352 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIFP27352 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIFP27352 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIFP27352 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIFP27352 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIFP27352 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIFP27352 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIFP27352 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIFP27352 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIFP27352 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIFP27352 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIFP27352 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIFP27352 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIFP27352 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIFP27352 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GIFP27352 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIFP27352 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIFP27352 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIFP27352 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIFP27352 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms