Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMA4P25789 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMA4P25789 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA4P25789 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms