Protein–RNA interactions for Protein: P25787

PSMA2, Proteasome subunit alpha type-2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA2P25787 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMA2P25787 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMA2P25787 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMA2P25787 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMA2P25787 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMA2P25787 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMA2P25787 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMA2P25787 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMA2P25787 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMA2P25787 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMA2P25787 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMA2P25787 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMA2P25787 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA2P25787 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMA2P25787 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMA2P25787 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms