Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A1P22736 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR4A1P22736 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A1P22736 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1348.8 ms