Protein–RNA interactions for Protein: P21283

ATP6V1C1, V-type proton ATPase subunit C 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1C1P21283 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1C1P21283 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1C1P21283 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1C1P21283 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1C1P21283 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1C1P21283 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6V1C1P21283 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6V1C1P21283 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6V1C1P21283 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6V1C1P21283 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6V1C1P21283 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6V1C1P21283 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1C1P21283 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1C1P21283 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1C1P21283 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms