Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTNP21246 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTNP21246 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTNP21246 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTNP21246 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTNP21246 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTNP21246 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTNP21246 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTNP21246 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTNP21246 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTNP21246 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTNP21246 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTNP21246 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTNP21246 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTNP21246 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTNP21246 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTNP21246 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTNP21246 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTNP21246 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTNP21246 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTNP21246 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTNP21246 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTNP21246 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTNP21246 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTNP21246 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTNP21246 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTNP21246 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTNP21246 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTNP21246 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTNP21246 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTNP21246 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTNP21246 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTNP21246 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTNP21246 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTNP21246 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTNP21246 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTNP21246 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTNP21246 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTNP21246 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTNP21246 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTNP21246 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTNP21246 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTNP21246 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTNP21246 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTNP21246 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTNP21246 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTNP21246 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTNP21246 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTNP21246 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTNP21246 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTNP21246 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTNP21246 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTNP21246 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTNP21246 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTNP21246 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTNP21246 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTNP21246 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTNP21246 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTNP21246 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTNP21246 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTNP21246 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTNP21246 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTNP21246 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTNP21246 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTNP21246 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTNP21246 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTNP21246 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTNP21246 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTNP21246 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTNP21246 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTNP21246 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTNP21246 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTNP21246 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTNP21246 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTNP21246 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTNP21246 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTNP21246 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTNP21246 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTNP21246 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTNP21246 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTNP21246 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTNP21246 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTNP21246 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTNP21246 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTNP21246 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTNP21246 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTNP21246 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTNP21246 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTNP21246 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTNP21246 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTNP21246 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTNP21246 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTNP21246 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTNP21246 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTNP21246 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTNP21246 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTNP21246 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTNP21246 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTNP21246 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTNP21246 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.5 ms