Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CASTP20810 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CASTP20810 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CASTP20810 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CASTP20810 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CASTP20810 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CASTP20810 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CASTP20810 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CASTP20810 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CASTP20810 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CASTP20810 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CASTP20810 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CASTP20810 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CASTP20810 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CASTP20810 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CASTP20810 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CASTP20810 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CASTP20810 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CASTP20810 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CASTP20810 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASTP20810 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CASTP20810 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASTP20810 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASTP20810 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASTP20810 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CASTP20810 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CASTP20810 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CASTP20810 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CASTP20810 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CASTP20810 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CASTP20810 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CASTP20810 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CASTP20810 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CASTP20810 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CASTP20810 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CASTP20810 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CASTP20810 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CASTP20810 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CASTP20810 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CASTP20810 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CASTP20810 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CASTP20810 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CASTP20810 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CASTP20810 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CASTP20810 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CASTP20810 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CASTP20810 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CASTP20810 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CASTP20810 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CASTP20810 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CASTP20810 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CASTP20810 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CASTP20810 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CASTP20810 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASTP20810 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASTP20810 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASTP20810 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASTP20810 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CASTP20810 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CASTP20810 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CASTP20810 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CASTP20810 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CASTP20810 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CASTP20810 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASTP20810 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASTP20810 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASTP20810 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASTP20810 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASTP20810 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASTP20810 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASTP20810 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CASTP20810 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CASTP20810 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CASTP20810 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CASTP20810 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CASTP20810 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CASTP20810 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CASTP20810 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CASTP20810 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CASTP20810 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CASTP20810 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CASTP20810 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CASTP20810 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CASTP20810 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CASTP20810 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASTP20810 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASTP20810 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASTP20810 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASTP20810 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASTP20810 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASTP20810 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASTP20810 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASTP20810 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASTP20810 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASTP20810 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CASTP20810 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CASTP20810 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CASTP20810 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CASTP20810 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CASTP20810 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms