Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2A2P16615 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2A2P16615 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2A2P16615 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms