Protein–RNA interactions for Protein: P15514

AREG, Amphiregulin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AREGP15514 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AREGP15514 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AREGP15514 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AREGP15514 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AREGP15514 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AREGP15514 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AREGP15514 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AREGP15514 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AREGP15514 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AREGP15514 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AREGP15514 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AREGP15514 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AREGP15514 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AREGP15514 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AREGP15514 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AREGP15514 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AREGP15514 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AREGP15514 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AREGP15514 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AREGP15514 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AREGP15514 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AREGP15514 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AREGP15514 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AREGP15514 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AREGP15514 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AREGP15514 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AREGP15514 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AREGP15514 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AREGP15514 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AREGP15514 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AREGP15514 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AREGP15514 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AREGP15514 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AREGP15514 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AREGP15514 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AREGP15514 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AREGP15514 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AREGP15514 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AREGP15514 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AREGP15514 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AREGP15514 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AREGP15514 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AREGP15514 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AREGP15514 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AREGP15514 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AREGP15514 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AREGP15514 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AREGP15514 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AREGP15514 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AREGP15514 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AREGP15514 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AREGP15514 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AREGP15514 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AREGP15514 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AREGP15514 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AREGP15514 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AREGP15514 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AREGP15514 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AREGP15514 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AREGP15514 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AREGP15514 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AREGP15514 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AREGP15514 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AREGP15514 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AREGP15514 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AREGP15514 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AREGP15514 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AREGP15514 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AREGP15514 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AREGP15514 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AREGP15514 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AREGP15514 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AREGP15514 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AREGP15514 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AREGP15514 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AREGP15514 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AREGP15514 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AREGP15514 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AREGP15514 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AREGP15514 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AREGP15514 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AREGP15514 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AREGP15514 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AREGP15514 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AREGP15514 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AREGP15514 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AREGP15514 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
AREGP15514 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AREGP15514 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AREGP15514 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AREGP15514 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AREGP15514 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1002.7 ms