Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF2P15336 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF2P15336 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF2P15336 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF2P15336 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF2P15336 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF2P15336 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF2P15336 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF2P15336 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF2P15336 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF2P15336 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF2P15336 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF2P15336 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF2P15336 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF2P15336 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF2P15336 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF2P15336 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF2P15336 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF2P15336 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF2P15336 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF2P15336 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF2P15336 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF2P15336 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF2P15336 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF2P15336 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF2P15336 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF2P15336 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF2P15336 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF2P15336 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF2P15336 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF2P15336 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF2P15336 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF2P15336 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF2P15336 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF2P15336 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF2P15336 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF2P15336 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF2P15336 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF2P15336 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF2P15336 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF2P15336 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF2P15336 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF2P15336 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF2P15336 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF2P15336 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF2P15336 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF2P15336 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATF2P15336 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF2P15336 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF2P15336 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF2P15336 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF2P15336 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF2P15336 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF2P15336 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF2P15336 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF2P15336 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF2P15336 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF2P15336 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF2P15336 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF2P15336 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF2P15336 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF2P15336 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF2P15336 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF2P15336 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF2P15336 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF2P15336 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF2P15336 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF2P15336 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF2P15336 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF2P15336 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF2P15336 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF2P15336 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF2P15336 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF2P15336 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF2P15336 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF2P15336 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF2P15336 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF2P15336 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF2P15336 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF2P15336 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF2P15336 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF2P15336 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF2P15336 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF2P15336 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF2P15336 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF2P15336 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF2P15336 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF2P15336 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF2P15336 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF2P15336 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF2P15336 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF2P15336 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF2P15336 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF2P15336 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF2P15336 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF2P15336 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF2P15336 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF2P15336 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF2P15336 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF2P15336 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms