Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF35P13682 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF35P13682 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF35P13682 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF35P13682 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF35P13682 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF35P13682 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF35P13682 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF35P13682 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF35P13682 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF35P13682 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF35P13682 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF35P13682 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms