Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRBP10828 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRBP10828 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRBP10828 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRBP10828 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRBP10828 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRBP10828 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRBP10828 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRBP10828 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRBP10828 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRBP10828 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRBP10828 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRBP10828 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRBP10828 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRBP10828 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRBP10828 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRBP10828 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRBP10828 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRBP10828 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRBP10828 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRBP10828 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRBP10828 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRBP10828 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRBP10828 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRBP10828 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRBP10828 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRBP10828 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THRBP10828 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THRBP10828 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THRBP10828 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THRBP10828 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THRBP10828 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRBP10828 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRBP10828 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRBP10828 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
THRBP10828 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRBP10828 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRBP10828 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRBP10828 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THRBP10828 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THRBP10828 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THRBP10828 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THRBP10828 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
THRBP10828 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRBP10828 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRBP10828 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRBP10828 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRBP10828 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRBP10828 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRBP10828 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRBP10828 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRBP10828 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRBP10828 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRBP10828 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRBP10828 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRBP10828 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRBP10828 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRBP10828 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRBP10828 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THRBP10828 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRBP10828 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRBP10828 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRBP10828 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRBP10828 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRBP10828 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRBP10828 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRBP10828 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THRBP10828 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRBP10828 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRBP10828 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRBP10828 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRBP10828 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRBP10828 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRBP10828 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRBP10828 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRBP10828 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRBP10828 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRBP10828 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRBP10828 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRBP10828 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRBP10828 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRBP10828 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRBP10828 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRBP10828 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRBP10828 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRBP10828 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRBP10828 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRBP10828 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRBP10828 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRBP10828 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRBP10828 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRBP10828 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRBP10828 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRBP10828 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRBP10828 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRBP10828 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRBP10828 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRBP10828 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRBP10828 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRBP10828 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms