Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HKR1P10072 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HKR1P10072 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HKR1P10072 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HKR1P10072 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HKR1P10072 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HKR1P10072 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HKR1P10072 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HKR1P10072 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HKR1P10072 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HKR1P10072 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HKR1P10072 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HKR1P10072 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HKR1P10072 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HKR1P10072 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HKR1P10072 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HKR1P10072 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HKR1P10072 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HKR1P10072 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HKR1P10072 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HKR1P10072 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HKR1P10072 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HKR1P10072 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HKR1P10072 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HKR1P10072 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HKR1P10072 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HKR1P10072 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HKR1P10072 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HKR1P10072 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HKR1P10072 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HKR1P10072 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HKR1P10072 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HKR1P10072 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HKR1P10072 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HKR1P10072 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HKR1P10072 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HKR1P10072 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HKR1P10072 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HKR1P10072 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HKR1P10072 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HKR1P10072 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HKR1P10072 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HKR1P10072 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HKR1P10072 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HKR1P10072 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HKR1P10072 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HKR1P10072 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HKR1P10072 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HKR1P10072 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HKR1P10072 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HKR1P10072 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HKR1P10072 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HKR1P10072 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HKR1P10072 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HKR1P10072 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HKR1P10072 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HKR1P10072 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HKR1P10072 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HKR1P10072 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HKR1P10072 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HKR1P10072 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HKR1P10072 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HKR1P10072 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HKR1P10072 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HKR1P10072 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HKR1P10072 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HKR1P10072 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HKR1P10072 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HKR1P10072 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HKR1P10072 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HKR1P10072 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HKR1P10072 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HKR1P10072 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HKR1P10072 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HKR1P10072 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HKR1P10072 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HKR1P10072 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HKR1P10072 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HKR1P10072 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HKR1P10072 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HKR1P10072 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HKR1P10072 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HKR1P10072 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HKR1P10072 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HKR1P10072 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HKR1P10072 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HKR1P10072 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HKR1P10072 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HKR1P10072 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HKR1P10072 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HKR1P10072 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HKR1P10072 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HKR1P10072 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HKR1P10072 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HKR1P10072 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HKR1P10072 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HKR1P10072 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HKR1P10072 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HKR1P10072 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HKR1P10072 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms