Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBSLP0DN79 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBSLP0DN79 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBSLP0DN79 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBSLP0DN79 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms