Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAA2P0DJI9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SAA2P0DJI9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAA2P0DJI9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms