Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD2P0DJD1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RGPD2P0DJD1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RGPD2P0DJD1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RGPD2P0DJD1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
RGPD2P0DJD1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RGPD2P0DJD1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RGPD2P0DJD1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RGPD2P0DJD1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RGPD2P0DJD1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RGPD2P0DJD1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD2P0DJD1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RGPD2P0DJD1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD2P0DJD1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD2P0DJD1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD2P0DJD1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD2P0DJD1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD2P0DJD1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD2P0DJD1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD2P0DJD1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD2P0DJD1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD2P0DJD1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD2P0DJD1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD2P0DJD1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD2P0DJD1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD2P0DJD1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
RGPD2P0DJD1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.8■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
RGPD2P0DJD1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms