Protein–RNA interactions for Protein: P01732

CD8A, T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8AP01732 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8AP01732 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8AP01732 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8AP01732 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8AP01732 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8AP01732 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8AP01732 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8AP01732 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8AP01732 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8AP01732 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8AP01732 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8AP01732 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8AP01732 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD8AP01732 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD8AP01732 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CD8AP01732 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD8AP01732 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD8AP01732 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD8AP01732 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD8AP01732 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD8AP01732 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD8AP01732 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD8AP01732 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD8AP01732 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD8AP01732 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD8AP01732 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD8AP01732 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD8AP01732 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD8AP01732 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD8AP01732 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD8AP01732 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD8AP01732 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD8AP01732 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD8AP01732 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD8AP01732 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD8AP01732 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD8AP01732 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD8AP01732 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD8AP01732 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD8AP01732 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD8AP01732 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD8AP01732 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD8AP01732 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD8AP01732 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD8AP01732 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD8AP01732 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD8AP01732 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD8AP01732 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD8AP01732 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD8AP01732 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD8AP01732 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD8AP01732 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD8AP01732 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD8AP01732 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD8AP01732 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD8AP01732 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD8AP01732 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD8AP01732 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD8AP01732 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CD8AP01732 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD8AP01732 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD8AP01732 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD8AP01732 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8AP01732 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8AP01732 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8AP01732 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8AP01732 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8AP01732 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8AP01732 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8AP01732 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8AP01732 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8AP01732 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8AP01732 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8AP01732 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD8AP01732 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD8AP01732 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD8AP01732 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD8AP01732 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD8AP01732 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD8AP01732 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8AP01732 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8AP01732 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8AP01732 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8AP01732 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8AP01732 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8AP01732 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD8AP01732 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8AP01732 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8AP01732 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8AP01732 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8AP01732 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8AP01732 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8AP01732 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8AP01732 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8AP01732 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8AP01732 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8AP01732 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8AP01732 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8AP01732 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8AP01732 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.1 ms