Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHEK2O96017 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHEK2O96017 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHEK2O96017 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms