Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
S1PR4O95977 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
S1PR4O95977 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
S1PR4O95977 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms