Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
SOGA1O94964 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
SOGA1O94964 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
SOGA1O94964 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
SOGA1O94964 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
SOGA1O94964 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
SOGA1O94964 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
SOGA1O94964 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
SOGA1O94964 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
SOGA1O94964 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
SOGA1O94964 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
SOGA1O94964 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
SOGA1O94964 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
SOGA1O94964 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SOGA1O94964 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
SOGA1O94964 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SOGA1O94964 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SOGA1O94964 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
SOGA1O94964 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
SOGA1O94964 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
SOGA1O94964 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
SOGA1O94964 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SOGA1O94964 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SOGA1O94964 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
SOGA1O94964 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
SOGA1O94964 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
SOGA1O94964 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
SOGA1O94964 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
SOGA1O94964 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
SOGA1O94964 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
SOGA1O94964 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
SOGA1O94964 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
SOGA1O94964 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
SOGA1O94964 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
SOGA1O94964 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
SOGA1O94964 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
SOGA1O94964 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
SOGA1O94964 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
SOGA1O94964 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC43.38■■■■■ 4.54
SOGA1O94964 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC43.38■■■■■ 4.53
SOGA1O94964 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
SOGA1O94964 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SOGA1O94964 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SOGA1O94964 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SOGA1O94964 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SOGA1O94964 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SOGA1O94964 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SOGA1O94964 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SOGA1O94964 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SOGA1O94964 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SOGA1O94964 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SOGA1O94964 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
SOGA1O94964 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
SOGA1O94964 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
SOGA1O94964 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
SOGA1O94964 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
SOGA1O94964 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
SOGA1O94964 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
SOGA1O94964 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
SOGA1O94964 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
SOGA1O94964 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SOGA1O94964 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SOGA1O94964 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SOGA1O94964 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
SOGA1O94964 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
SOGA1O94964 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
SOGA1O94964 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
SOGA1O94964 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC43.21■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
SOGA1O94964 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
SOGA1O94964 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
SOGA1O94964 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
SOGA1O94964 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
SOGA1O94964 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
SOGA1O94964 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
SOGA1O94964 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
SOGA1O94964 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
SOGA1O94964 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SOGA1O94964 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.5
SOGA1O94964 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
SOGA1O94964 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.8 ms