Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LTN1O94822 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LTN1O94822 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LTN1O94822 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LTN1O94822 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LTN1O94822 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LTN1O94822 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LTN1O94822 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LTN1O94822 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LTN1O94822 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LTN1O94822 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LTN1O94822 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LTN1O94822 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LTN1O94822 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LTN1O94822 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LTN1O94822 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LTN1O94822 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LTN1O94822 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LTN1O94822 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LTN1O94822 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LTN1O94822 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LTN1O94822 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LTN1O94822 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LTN1O94822 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LTN1O94822 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LTN1O94822 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LTN1O94822 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LTN1O94822 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LTN1O94822 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LTN1O94822 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
LTN1O94822 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LTN1O94822 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTN1O94822 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTN1O94822 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTN1O94822 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTN1O94822 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTN1O94822 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LTN1O94822 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LTN1O94822 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LTN1O94822 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LTN1O94822 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LTN1O94822 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
LTN1O94822 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LTN1O94822 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LTN1O94822 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LTN1O94822 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
LTN1O94822 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
LTN1O94822 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTN1O94822 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTN1O94822 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTN1O94822 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
LTN1O94822 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTN1O94822 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTN1O94822 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTN1O94822 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTN1O94822 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTN1O94822 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTN1O94822 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTN1O94822 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LTN1O94822 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
LTN1O94822 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LTN1O94822 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
LTN1O94822 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LTN1O94822 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LTN1O94822 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LTN1O94822 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LTN1O94822 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LTN1O94822 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LTN1O94822 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
LTN1O94822 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LTN1O94822 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LTN1O94822 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LTN1O94822 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LTN1O94822 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LTN1O94822 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LTN1O94822 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LTN1O94822 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LTN1O94822 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LTN1O94822 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LTN1O94822 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LTN1O94822 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LTN1O94822 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LTN1O94822 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LTN1O94822 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LTN1O94822 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LTN1O94822 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LTN1O94822 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LTN1O94822 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LTN1O94822 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LTN1O94822 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LTN1O94822 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
LTN1O94822 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LTN1O94822 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LTN1O94822 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LTN1O94822 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LTN1O94822 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LTN1O94822 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LTN1O94822 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LTN1O94822 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LTN1O94822 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms