Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC3O15379 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC3O15379 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC3O15379 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC3O15379 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.7 ms