Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SETD1AO15047 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SETD1AO15047 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SETD1AO15047 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SETD1AO15047 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SETD1AO15047 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SETD1AO15047 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SETD1AO15047 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SETD1AO15047 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SETD1AO15047 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SETD1AO15047 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SETD1AO15047 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SETD1AO15047 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SETD1AO15047 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SETD1AO15047 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SETD1AO15047 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SETD1AO15047 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SETD1AO15047 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SETD1AO15047 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SETD1AO15047 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SETD1AO15047 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SETD1AO15047 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SETD1AO15047 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SETD1AO15047 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
SETD1AO15047 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SETD1AO15047 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SETD1AO15047 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SETD1AO15047 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SETD1AO15047 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SETD1AO15047 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms