Protein–RNA interactions for Protein: O14796

SH2D1B, SH2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D1BO14796 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2D1BO14796 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH2D1BO14796 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2D1BO14796 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2D1BO14796 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2D1BO14796 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH2D1BO14796 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH2D1BO14796 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SH2D1BO14796 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH2D1BO14796 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D1BO14796 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D1BO14796 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D1BO14796 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D1BO14796 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D1BO14796 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D1BO14796 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D1BO14796 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D1BO14796 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D1BO14796 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D1BO14796 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D1BO14796 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D1BO14796 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D1BO14796 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D1BO14796 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D1BO14796 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D1BO14796 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D1BO14796 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D1BO14796 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH2D1BO14796 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH2D1BO14796 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms