Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TOR1AO14656 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TOR1AO14656 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TOR1AO14656 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOR1AO14656 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR1AO14656 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR1AO14656 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOR1AO14656 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR1AO14656 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TOR1AO14656 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TOR1AO14656 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOR1AO14656 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOR1AO14656 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOR1AO14656 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOR1AO14656 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOR1AO14656 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOR1AO14656 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOR1AO14656 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOR1AO14656 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR1AO14656 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR1AO14656 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR1AO14656 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR1AO14656 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOR1AO14656 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOR1AO14656 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOR1AO14656 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOR1AO14656 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TOR1AO14656 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOR1AO14656 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOR1AO14656 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOR1AO14656 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TOR1AO14656 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOR1AO14656 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOR1AO14656 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TOR1AO14656 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOR1AO14656 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOR1AO14656 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms