Protein–RNA interactions for Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CHD1O14646 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CHD1O14646 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
CHD1O14646 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CHD1O14646 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
CHD1O14646 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CHD1O14646 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CHD1O14646 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CHD1O14646 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
CHD1O14646 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.4
CHD1O14646 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHD1O14646 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHD1O14646 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHD1O14646 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHD1O14646 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHD1O14646 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHD1O14646 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHD1O14646 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHD1O14646 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHD1O14646 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CHD1O14646 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CHD1O14646 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CHD1O14646 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
CHD1O14646 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
CHD1O14646 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CHD1O14646 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CHD1O14646 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CHD1O14646 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CHD1O14646 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CHD1O14646 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CHD1O14646 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CHD1O14646 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CHD1O14646 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
CHD1O14646 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CHD1O14646 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CHD1O14646 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CHD1O14646 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CHD1O14646 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CHD1O14646 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CHD1O14646 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CHD1O14646 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CHD1O14646 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CHD1O14646 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CHD1O14646 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CHD1O14646 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CHD1O14646 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
CHD1O14646 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
CHD1O14646 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CHD1O14646 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CHD1O14646 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CHD1O14646 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CHD1O14646 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CHD1O14646 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
CHD1O14646 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CHD1O14646 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
CHD1O14646 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CHD1O14646 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CHD1O14646 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CHD1O14646 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CHD1O14646 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CHD1O14646 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CHD1O14646 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CHD1O14646 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CHD1O14646 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CHD1O14646 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CHD1O14646 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
CHD1O14646 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CHD1O14646 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CHD1O14646 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CHD1O14646 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CHD1O14646 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CHD1O14646 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CHD1O14646 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CHD1O14646 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CHD1O14646 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CHD1O14646 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CHD1O14646 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CHD1O14646 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CHD1O14646 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CHD1O14646 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
CHD1O14646 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CHD1O14646 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
CHD1O14646 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CHD1O14646 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CHD1O14646 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CHD1O14646 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
CHD1O14646 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CHD1O14646 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC42.32■■■■■ 4.36
CHD1O14646 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.36
CHD1O14646 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CHD1O14646 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CHD1O14646 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CHD1O14646 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CHD1O14646 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CHD1O14646 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CHD1O14646 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CHD1O14646 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CHD1O14646 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CHD1O14646 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
CHD1O14646 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms