Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TULP1O00294 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TULP1O00294 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TULP1O00294 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TULP1O00294 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TULP1O00294 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TULP1O00294 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TULP1O00294 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TULP1O00294 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP1O00294 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP1O00294 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP1O00294 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TULP1O00294 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP1O00294 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP1O00294 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP1O00294 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP1O00294 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP1O00294 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP1O00294 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP1O00294 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP1O00294 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP1O00294 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP1O00294 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP1O00294 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP1O00294 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP1O00294 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP1O00294 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP1O00294 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP1O00294 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP1O00294 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP1O00294 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP1O00294 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP1O00294 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP1O00294 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP1O00294 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP1O00294 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP1O00294 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP1O00294 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP1O00294 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP1O00294 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP1O00294 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP1O00294 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP1O00294 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP1O00294 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP1O00294 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP1O00294 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP1O00294 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP1O00294 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP1O00294 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TULP1O00294 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP1O00294 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP1O00294 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP1O00294 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP1O00294 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP1O00294 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP1O00294 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP1O00294 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP1O00294 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP1O00294 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP1O00294 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP1O00294 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP1O00294 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TULP1O00294 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TULP1O00294 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TULP1O00294 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TULP1O00294 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TULP1O00294 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TULP1O00294 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TULP1O00294 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TULP1O00294 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TULP1O00294 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP1O00294 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP1O00294 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP1O00294 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP1O00294 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP1O00294 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP1O00294 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP1O00294 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP1O00294 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP1O00294 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP1O00294 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TULP1O00294 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TULP1O00294 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP1O00294 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP1O00294 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP1O00294 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP1O00294 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP1O00294 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP1O00294 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP1O00294 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP1O00294 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP1O00294 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP1O00294 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP1O00294 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TULP1O00294 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TULP1O00294 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TULP1O00294 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TULP1O00294 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TULP1O00294 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TULP1O00294 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms