Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGRPO00253 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AGRPO00253 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGRPO00253 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGRPO00253 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGRPO00253 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGRPO00253 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGRPO00253 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AGRPO00253 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGRPO00253 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGRPO00253 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGRPO00253 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGRPO00253 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AGRPO00253 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGRPO00253 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGRPO00253 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGRPO00253 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGRPO00253 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGRPO00253 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGRPO00253 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGRPO00253 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGRPO00253 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGRPO00253 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGRPO00253 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGRPO00253 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGRPO00253 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGRPO00253 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGRPO00253 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGRPO00253 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGRPO00253 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGRPO00253 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGRPO00253 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGRPO00253 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AGRPO00253 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGRPO00253 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGRPO00253 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGRPO00253 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGRPO00253 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGRPO00253 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGRPO00253 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGRPO00253 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGRPO00253 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGRPO00253 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGRPO00253 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGRPO00253 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGRPO00253 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGRPO00253 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGRPO00253 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGRPO00253 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGRPO00253 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGRPO00253 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGRPO00253 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGRPO00253 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGRPO00253 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGRPO00253 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGRPO00253 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGRPO00253 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGRPO00253 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGRPO00253 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGRPO00253 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGRPO00253 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGRPO00253 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGRPO00253 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGRPO00253 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGRPO00253 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGRPO00253 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGRPO00253 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGRPO00253 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGRPO00253 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGRPO00253 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGRPO00253 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGRPO00253 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGRPO00253 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AGRPO00253 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGRPO00253 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AGRPO00253 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGRPO00253 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGRPO00253 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AGRPO00253 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AGRPO00253 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGRPO00253 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGRPO00253 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGRPO00253 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGRPO00253 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGRPO00253 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGRPO00253 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGRPO00253 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGRPO00253 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGRPO00253 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGRPO00253 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGRPO00253 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AGRPO00253 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AGRPO00253 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGRPO00253 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGRPO00253 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGRPO00253 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGRPO00253 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGRPO00253 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGRPO00253 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AGRPO00253 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms