Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3QQQ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3QQQ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3QQQ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3QQQ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3QQQ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QQQ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QQQ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QQQ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QQQ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QQQ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QQQ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QQQ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3QQQ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3QQQ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3QQQ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
J3QQQ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3QQQ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3QQQ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3QQQ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3QQQ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3QQQ9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3QQQ9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3QQQ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3QQQ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3QQQ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3QQQ9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3QQQ9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3QQQ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3QQQ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3QQQ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QQQ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QQQ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QQQ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QQQ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QQQ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QQQ9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QQQ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QQQ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QQQ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3QQQ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3QQQ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3QQQ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3QQQ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3QQQ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3QQQ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3QQQ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3QQQ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3QQQ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3QQQ9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3QQQ9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3QQQ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3QQQ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3QQQ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3QQQ9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3QQQ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3QQQ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3QQQ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3QQQ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3QQQ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3QQQ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3QQQ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3QQQ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3QQQ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3QQQ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3QQQ9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3QQQ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3QQQ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3QQQ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3QQQ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3QQQ9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3QQQ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3QQQ9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3QQQ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3QQQ9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3QQQ9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
J3QQQ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
J3QQQ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
J3QQQ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3QQQ9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3QQQ9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3QQQ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3QQQ9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3QQQ9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3QQQ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3QQQ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3QQQ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3QQQ9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3QQQ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3QQQ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3QQQ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3QQQ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3QQQ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3QQQ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3QQQ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3QQQ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3QQQ9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3QQQ9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3QQQ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3QQQ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms