Protein–RNA interactions for Protein: H3BSH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSH0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BSH0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BSH0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BSH0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BSH0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BSH0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSH0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSH0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSH0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSH0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSH0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSH0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSH0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSH0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSH0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSH0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSH0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSH0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSH0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSH0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSH0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSH0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BSH0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BSH0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BSH0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BSH0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BSH0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BSH0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BSH0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BSH0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BSH0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H3BSH0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BSH0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BSH0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BSH0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BSH0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BSH0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BSH0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BSH0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BSH0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BSH0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BSH0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BSH0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BSH0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BSH0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BSH0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BSH0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BSH0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BSH0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BSH0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BSH0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BSH0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BSH0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BSH0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BSH0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BSH0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BSH0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BSH0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BSH0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BSH0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BSH0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BSH0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BSH0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BSH0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BSH0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BSH0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BSH0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BSH0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BSH0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BSH0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BSH0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BSH0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BSH0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BSH0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BSH0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BSH0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BSH0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BSH0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BSH0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BSH0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BSH0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BSH0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BSH0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BSH0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BSH0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BSH0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BSH0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BSH0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BSH0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BSH0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BSH0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BSH0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BSH0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BSH0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BSH0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BSH0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3BSH0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3BSH0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BSH0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BSH0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms