Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BECN2A8MW95 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BECN2A8MW95 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BECN2A8MW95 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BECN2A8MW95 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BECN2A8MW95 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BECN2A8MW95 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BECN2A8MW95 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BECN2A8MW95 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BECN2A8MW95 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BECN2A8MW95 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BECN2A8MW95 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BECN2A8MW95 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BECN2A8MW95 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BECN2A8MW95 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BECN2A8MW95 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BECN2A8MW95 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BECN2A8MW95 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BECN2A8MW95 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BECN2A8MW95 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BECN2A8MW95 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
BECN2A8MW95 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BECN2A8MW95 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms