Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCT8L1PA6NM43 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT8L1PA6NM43 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT8L1PA6NM43 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT8L1PA6NM43 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms