Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CBY3A6NI87 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CBY3A6NI87 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBY3A6NI87 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms