Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC78A2IDD5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC78A2IDD5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC78A2IDD5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC78A2IDD5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms