Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms