Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
A0A087WWV3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A087WWV3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
A0A087WWV3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms