Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.196e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 USP48-207ENST00000471752 445 ntTSL 37.56□□□□□ -1.24e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.236e-6■□□□□ 8.4
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NIPBLQ6KC79 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.256e-6■□□□□ 8.4
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