RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549273.5

RPL18-205, Transcript of ribosomal protein L18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPL18, Length 1,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18-205ENST00000549273 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.48■■■□□ 2.79
RPL18-205ENST00000549273 ABCC9O60706 1549 aa29.18■■■□□ 2.26
RPL18-205ENST00000549273 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.05■■■□□ 2.24
RPL18-205ENST00000549273 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.77■■■□□ 2.04
RPL18-205ENST00000549273 NACADO15069 1562 aa27.59■■■□□ 2.01
RPL18-205ENST00000549273 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.57■■■□□ 2
RPL18-205ENST00000549273 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.47■■□□□ 1.99
RPL18-205ENST00000549273 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.25■■□□□ 1.95
RPL18-205ENST00000549273 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
RPL18-205ENST00000549273 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.9■■□□□ 1.9
RPL18-205ENST00000549273 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.88■■□□□ 1.89
RPL18-205ENST00000549273 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
RPL18-205ENST00000549273 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.85■■□□□ 1.89
RPL18-205ENST00000549273 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.65■■□□□ 1.86
RPL18-205ENST00000549273 SCRIBQ14160 1630 aa26.47■■□□□ 1.83
RPL18-205ENST00000549273 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.33■■□□□ 1.81
RPL18-205ENST00000549273 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.31■■□□□ 1.8
RPL18-205ENST00000549273 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
RPL18-205ENST00000549273 NCAPD3P42695 1498 aa25.53■■□□□ 1.68
RPL18-205ENST00000549273 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.4■■□□□ 1.66
RPL18-205ENST00000549273 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.34■■□□□ 1.65
RPL18-205ENST00000549273 SMARCA2P51531 1590 aa25.32■■□□□ 1.64
RPL18-205ENST00000549273 SMARCA4P51532 1647 aa25.27■■□□□ 1.64
RPL18-205ENST00000549273 HMGXB3Q12766 1538 aa25.25■■□□□ 1.63
RPL18-205ENST00000549273 ERCC6Q03468 1493 aa25.24■■□□□ 1.63
RPL18-205ENST00000549273 CUX2O14529 1486 aa25.22■■□□□ 1.63
RPL18-205ENST00000549273 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RPL18-205ENST00000549273 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
RPL18-205ENST00000549273 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.07■■□□□ 1.6
RPL18-205ENST00000549273 NESP48681 1621 aa25.03■■□□□ 1.6
RPL18-205ENST00000549273 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.99■■□□□ 1.59
RPL18-205ENST00000549273 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.88■■□□□ 1.57
RPL18-205ENST00000549273 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.85■■□□□ 1.57
RPL18-205ENST00000549273 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.78■■□□□ 1.56
RPL18-205ENST00000549273 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
RPL18-205ENST00000549273 WIZO95785 1651 aa24.62■■□□□ 1.53
RPL18-205ENST00000549273 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.58■■□□□ 1.53
RPL18-205ENST00000549273 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.55■■□□□ 1.52
RPL18-205ENST00000549273 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
RPL18-205ENST00000549273 WDR62O43379 1518 aa24.45■■□□□ 1.5
RPL18-205ENST00000549273 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.45■■□□□ 1.5
RPL18-205ENST00000549273 CFTRP13569 1480 aa24.44■■□□□ 1.5
RPL18-205ENST00000549273 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.43■■□□□ 1.5
RPL18-205ENST00000549273 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RPL18-205ENST00000549273 OSCARQ8IYS5 282 aa24.18■■□□□ 1.46
RPL18-205ENST00000549273 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RPL18-205ENST00000549273 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.15■■□□□ 1.46
RPL18-205ENST00000549273 TRIM41Q8WV44 630 aa24.15■■□□□ 1.46
RPL18-205ENST00000549273 IFT140Q96RY7 1462 aa23.99■■□□□ 1.43
RPL18-205ENST00000549273 ABCC8Q09428 1581 aa23.98■■□□□ 1.43
RPL18-205ENST00000549273 PRDM2Q13029 1718 aa23.93■■□□□ 1.42
RPL18-205ENST00000549273 TOPBP1Q92547 1522 aa23.93■■□□□ 1.42
RPL18-205ENST00000549273 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
RPL18-205ENST00000549273 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.82■■□□□ 1.4
RPL18-205ENST00000549273 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.395e-8■■■■■ 45.6
RPL18-205ENST00000549273 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
RPL18-205ENST00000549273 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RPL18-205ENST00000549273 SOGA1O94964 1423 aa23.67■■□□□ 1.38
RPL18-205ENST00000549273 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
RPL18-205ENST00000549273 FBLN2P98095 1184 aa23.66■■□□□ 1.38
RPL18-205ENST00000549273 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.63■■□□□ 1.37
RPL18-205ENST00000549273 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.63■■□□□ 1.37
RPL18-205ENST00000549273 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.63■■□□□ 1.37
RPL18-205ENST00000549273 ARHGEF11O15085 1522 aa23.62■■□□□ 1.37
RPL18-205ENST00000549273 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
RPL18-205ENST00000549273 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.6■■□□□ 1.37
RPL18-205ENST00000549273 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.57■■□□□ 1.36
RPL18-205ENST00000549273 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.52■■□□□ 1.36
RPL18-205ENST00000549273 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
RPL18-205ENST00000549273 WDR97A6NE52 1622 aa23.48■■□□□ 1.35
RPL18-205ENST00000549273 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RPL18-205ENST00000549273 CUX1P39880 1505 aa23.47■■□□□ 1.35
RPL18-205ENST00000549273 CHD1O14646 1710 aa23.44■■□□□ 1.34
RPL18-205ENST00000549273 GRIN2BQ13224 1484 aa23.43■■□□□ 1.34
RPL18-205ENST00000549273 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.43■■□□□ 1.34
RPL18-205ENST00000549273 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
RPL18-205ENST00000549273 ARAP1Q96P48 1450 aa23.37■■□□□ 1.33
RPL18-205ENST00000549273 SYNJ2O15056 1496 aa23.35■■□□□ 1.33
RPL18-205ENST00000549273 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
RPL18-205ENST00000549273 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.34■■□□□ 1.33
RPL18-205ENST00000549273 SYNJ1O43426 1573 aa23.31■■□□□ 1.32
RPL18-205ENST00000549273 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.29■■□□□ 1.32
RPL18-205ENST00000549273 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.28■■□□□ 1.32
RPL18-205ENST00000549273 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.311e-7■■■■■ 66.8
RPL18-205ENST00000549273 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.15■■□□□ 1.3
RPL18-205ENST00000549273 PBRM1Q86U86 1689 aa23.13■■□□□ 1.29
RPL18-205ENST00000549273 TOP2BQ02880 1626 aa23.09■■□□□ 1.29
RPL18-205ENST00000549273 GRIN2AQ12879 1464 aa23.09■■□□□ 1.29
RPL18-205ENST00000549273 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.07■■□□□ 1.28
RPL18-205ENST00000549273 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.04■■□□□ 1.28
RPL18-205ENST00000549273 NUP160Q12769 1436 aa23.03■■□□□ 1.28
RPL18-205ENST00000549273 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.99■■□□□ 1.27
RPL18-205ENST00000549273 ADAMTS12P58397 1594 aa22.98■■□□□ 1.27
RPL18-205ENST00000549273 CEP170Q5SW79 1584 aa22.93■■□□□ 1.26
RPL18-205ENST00000549273 JPH4Q96JJ6 628 aa22.91■■□□□ 1.26
RPL18-205ENST00000549273 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.89■■□□□ 1.25
RPL18-205ENST00000549273 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RPL18-205ENST00000549273 SHROOM2Q13796 1616 aa22.84■■□□□ 1.25
RPL18-205ENST00000549273 IGF1RP08069 1367 aa22.77■■□□□ 1.24
RPL18-205ENST00000549273 KIF27Q86VH2 1401 aa22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms