RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484835.1

SKIV2L-210, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 931 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-210ENST00000484835 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.56■■■■■ 4.08
SKIV2L-210ENST00000484835 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.08■■■■□ 3.37
SKIV2L-210ENST00000484835 ABCC9O60706 1549 aa34.83■■■■□ 3.17
SKIV2L-210ENST00000484835 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
SKIV2L-210ENST00000484835 NACADO15069 1562 aa33.74■■■□□ 2.99
SKIV2L-210ENST00000484835 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.72■■■□□ 2.99
SKIV2L-210ENST00000484835 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.64■■■□□ 2.98
SKIV2L-210ENST00000484835 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.62■■■□□ 2.97
SKIV2L-210ENST00000484835 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.57■■■□□ 2.96
SKIV2L-210ENST00000484835 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.1■■■□□ 2.89
SKIV2L-210ENST00000484835 SCRIBQ14160 1630 aa32.86■■■□□ 2.85
SKIV2L-210ENST00000484835 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.7■■■□□ 2.82
SKIV2L-210ENST00000484835 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.49■■■□□ 2.79
SKIV2L-210ENST00000484835 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.4■■■□□ 2.78
SKIV2L-210ENST00000484835 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
SKIV2L-210ENST00000484835 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.6■■■□□ 2.65
SKIV2L-210ENST00000484835 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.58■■■□□ 2.65
SKIV2L-210ENST00000484835 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.52■■■□□ 2.64
SKIV2L-210ENST00000484835 SMARCA4P51532 1647 aa31.48■■■□□ 2.63
SKIV2L-210ENST00000484835 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
SKIV2L-210ENST00000484835 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.26■■■□□ 2.59
SKIV2L-210ENST00000484835 SMARCA2P51531 1590 aa31.17■■■□□ 2.58
SKIV2L-210ENST00000484835 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.16■■■□□ 2.58
SKIV2L-210ENST00000484835 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.14■■■□□ 2.57
SKIV2L-210ENST00000484835 NCAPD3P42695 1498 aa31.07■■■□□ 2.56
SKIV2L-210ENST00000484835 HMGXB3Q12766 1538 aa31.04■■■□□ 2.56
SKIV2L-210ENST00000484835 WIZO95785 1651 aa31■■■□□ 2.55
SKIV2L-210ENST00000484835 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
SKIV2L-210ENST00000484835 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
SKIV2L-210ENST00000484835 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
SKIV2L-210ENST00000484835 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
SKIV2L-210ENST00000484835 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.28■■■□□ 2.44
SKIV2L-210ENST00000484835 NESP48681 1621 aa30.24■■■□□ 2.43
SKIV2L-210ENST00000484835 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.24■■■□□ 2.43
SKIV2L-210ENST00000484835 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.15■■■□□ 2.42
SKIV2L-210ENST00000484835 PRDM2Q13029 1718 aa30.12■■■□□ 2.41
SKIV2L-210ENST00000484835 CFTRP13569 1480 aa30.07■■■□□ 2.4
SKIV2L-210ENST00000484835 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.04■■■□□ 2.4
SKIV2L-210ENST00000484835 ERCC6Q03468 1493 aa30.01■■■□□ 2.4
SKIV2L-210ENST00000484835 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.97■■■□□ 2.39
SKIV2L-210ENST00000484835 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.85■■■□□ 2.37
SKIV2L-210ENST00000484835 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
SKIV2L-210ENST00000484835 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.81■■■□□ 2.36
SKIV2L-210ENST00000484835 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.7■■■□□ 2.35
SKIV2L-210ENST00000484835 WDR62O43379 1518 aa29.63■■■□□ 2.33
SKIV2L-210ENST00000484835 CUX2O14529 1486 aa29.61■■■□□ 2.33
SKIV2L-210ENST00000484835 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
SKIV2L-210ENST00000484835 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.47■■■□□ 2.31
SKIV2L-210ENST00000484835 TOPBP1Q92547 1522 aa29.43■■■□□ 2.3
SKIV2L-210ENST00000484835 ABCC8Q09428 1581 aa29.43■■■□□ 2.3
SKIV2L-210ENST00000484835 CUX1P39880 1505 aa29.33■■■□□ 2.29
SKIV2L-210ENST00000484835 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.23■■■□□ 2.27
SKIV2L-210ENST00000484835 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.21■■■□□ 2.27
SKIV2L-210ENST00000484835 TOP2BQ02880 1626 aa29.2■■■□□ 2.26
SKIV2L-210ENST00000484835 SYNJ1O43426 1573 aa29.19■■■□□ 2.26
SKIV2L-210ENST00000484835 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
SKIV2L-210ENST00000484835 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.17■■■□□ 2.26
SKIV2L-210ENST00000484835 IFT140Q96RY7 1462 aa29.15■■■□□ 2.26
SKIV2L-210ENST00000484835 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
SKIV2L-210ENST00000484835 WDR97A6NE52 1622 aa29.05■■■□□ 2.24
SKIV2L-210ENST00000484835 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.02■■■□□ 2.24
SKIV2L-210ENST00000484835 SOGA1O94964 1423 aa29.01■■■□□ 2.23
SKIV2L-210ENST00000484835 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SKIV2L-210ENST00000484835 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
SKIV2L-210ENST00000484835 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.9■■■□□ 2.22
SKIV2L-210ENST00000484835 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.83■■■□□ 2.21
SKIV2L-210ENST00000484835 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.22e-7■■■□□ 19
SKIV2L-210ENST00000484835 PBRM1Q86U86 1689 aa28.81■■■□□ 2.2
SKIV2L-210ENST00000484835 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
SKIV2L-210ENST00000484835 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.72■■■□□ 2.19
SKIV2L-210ENST00000484835 GRIN2BQ13224 1484 aa28.69■■■□□ 2.18
SKIV2L-210ENST00000484835 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.62■■■□□ 2.17
SKIV2L-210ENST00000484835 TRIM41Q8WV44 630 aa28.62■■■□□ 2.17
SKIV2L-210ENST00000484835 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SKIV2L-210ENST00000484835 CHD1O14646 1710 aa28.61■■■□□ 2.17
SKIV2L-210ENST00000484835 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.59■■■□□ 2.17
SKIV2L-210ENST00000484835 KIF27Q86VH2 1401 aa28.56■■■□□ 2.16
SKIV2L-210ENST00000484835 ADAMTS12P58397 1594 aa28.54■■■□□ 2.16
SKIV2L-210ENST00000484835 SYNJ2O15056 1496 aa28.48■■■□□ 2.15
SKIV2L-210ENST00000484835 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.48■■■□□ 2.15
SKIV2L-210ENST00000484835 CUL7Q14999 1698 aa28.45■■■□□ 2.15
SKIV2L-210ENST00000484835 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.4■■■□□ 2.14
SKIV2L-210ENST00000484835 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.38■■■□□ 2.13
SKIV2L-210ENST00000484835 IGF1RP08069 1367 aa28.36■■■□□ 2.13
SKIV2L-210ENST00000484835 GRIN2AQ12879 1464 aa28.34■■■□□ 2.13
SKIV2L-210ENST00000484835 FBLN2P98095 1184 aa28.34■■■□□ 2.13
SKIV2L-210ENST00000484835 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
SKIV2L-210ENST00000484835 OSCARQ8IYS5 282 aa28.31■■■□□ 2.12
SKIV2L-210ENST00000484835 EEA1Q15075 1411 aa28.25■■■□□ 2.11
SKIV2L-210ENST00000484835 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.23■■■□□ 2.11
SKIV2L-210ENST00000484835 CEP170Q5SW79 1584 aa28.22■■■□□ 2.11
SKIV2L-210ENST00000484835 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.22■■■□□ 2.11
SKIV2L-210ENST00000484835 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.22■■■□□ 2.11
SKIV2L-210ENST00000484835 NUP160Q12769 1436 aa28.19■■■□□ 2.1
SKIV2L-210ENST00000484835 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.13■■■□□ 2.09
SKIV2L-210ENST00000484835 PRXQ9BXM0 1461 aa28.11■■■□□ 2.09
SKIV2L-210ENST00000484835 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.05■■■□□ 2.08
SKIV2L-210ENST00000484835 SHROOM2Q13796 1616 aa28.03■■■□□ 2.08
SKIV2L-210ENST00000484835 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.03■■■□□ 2.08
SKIV2L-210ENST00000484835 KIF21BO75037 1637 aa28.01■■■□□ 2.07
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