Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U3KQA8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U3KQA8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U3KQA8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
U3KQA8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U3KQA8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U3KQA8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U3KQA8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U3KQA8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U3KQA8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U3KQA8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U3KQA8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U3KQA8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
U3KQA8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U3KQA8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
U3KQA8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U3KQA8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U3KQA8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U3KQA8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
U3KQA8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U3KQA8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U3KQA8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U3KQA8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U3KQA8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U3KQA8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U3KQA8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
U3KQA8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U3KQA8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U3KQA8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U3KQA8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U3KQA8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
U3KQA8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
U3KQA8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
U3KQA8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
U3KQA8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
U3KQA8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
U3KQA8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U3KQA8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U3KQA8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U3KQA8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U3KQA8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U3KQA8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U3KQA8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U3KQA8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U3KQA8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
U3KQA8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U3KQA8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U3KQA8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U3KQA8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U3KQA8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U3KQA8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
U3KQA8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
U3KQA8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U3KQA8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
U3KQA8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U3KQA8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U3KQA8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U3KQA8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U3KQA8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
U3KQA8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U3KQA8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
U3KQA8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U3KQA8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
U3KQA8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U3KQA8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U3KQA8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U3KQA8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U3KQA8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U3KQA8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U3KQA8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U3KQA8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U3KQA8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U3KQA8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U3KQA8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U3KQA8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
U3KQA8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U3KQA8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U3KQA8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U3KQA8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U3KQA8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U3KQA8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U3KQA8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U3KQA8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U3KQA8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U3KQA8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U3KQA8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U3KQA8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U3KQA8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
U3KQA8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U3KQA8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
U3KQA8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U3KQA8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U3KQA8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U3KQA8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U3KQA8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U3KQA8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U3KQA8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U3KQA8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U3KQA8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U3KQA8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms