Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NCOA3Q9Y6Q9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NCOA3Q9Y6Q9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCOA3Q9Y6Q9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCOA3Q9Y6Q9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCOA3Q9Y6Q9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NCOA3Q9Y6Q9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NCOA3Q9Y6Q9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NCOA3Q9Y6Q9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NCOA3Q9Y6Q9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCOA3Q9Y6Q9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCOA3Q9Y6Q9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCOA3Q9Y6Q9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCOA3Q9Y6Q9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NCOA3Q9Y6Q9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NCOA3Q9Y6Q9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NCOA3Q9Y6Q9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NCOA3Q9Y6Q9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NCOA3Q9Y6Q9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NCOA3Q9Y6Q9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
NCOA3Q9Y6Q9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NCOA3Q9Y6Q9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NCOA3Q9Y6Q9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NCOA3Q9Y6Q9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NCOA3Q9Y6Q9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NCOA3Q9Y6Q9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NCOA3Q9Y6Q9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
NCOA3Q9Y6Q9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NCOA3Q9Y6Q9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCOA3Q9Y6Q9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCOA3Q9Y6Q9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCOA3Q9Y6Q9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NCOA3Q9Y6Q9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NCOA3Q9Y6Q9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCOA3Q9Y6Q9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCOA3Q9Y6Q9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCOA3Q9Y6Q9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCOA3Q9Y6Q9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCOA3Q9Y6Q9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCOA3Q9Y6Q9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCOA3Q9Y6Q9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms