Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJA3Q9Y6H8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJA3Q9Y6H8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJA3Q9Y6H8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJA3Q9Y6H8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJA3Q9Y6H8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJA3Q9Y6H8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJA3Q9Y6H8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJA3Q9Y6H8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJA3Q9Y6H8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJA3Q9Y6H8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GJA3Q9Y6H8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GJA3Q9Y6H8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJA3Q9Y6H8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GJA3Q9Y6H8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GJA3Q9Y6H8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GJA3Q9Y6H8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GJA3Q9Y6H8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GJA3Q9Y6H8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJA3Q9Y6H8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJA3Q9Y6H8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJA3Q9Y6H8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJA3Q9Y6H8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJA3Q9Y6H8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJA3Q9Y6H8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJA3Q9Y6H8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
GJA3Q9Y6H8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJA3Q9Y6H8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GJA3Q9Y6H8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJA3Q9Y6H8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms